Credo sia possibile che le portiere con il peso dei vetri ecc. si abbassino un pò.
Del resto per allinearle devi avere le maniglie e le chiusure che devono funzionare.
Nulla vieta di mettere dentro il vetro per registrare la porta, prima però regoli la porta, dopo il vetro.
Per il resto cerca di fare il lavoro più definitivo possibile, quando avrai finito non avrai nessuna voglia di rismontare nulla.